故事发生在人猿的全球革命和人类之间的残酷核战争十年后，凯撒必须保护人猿和人类两方的幸存者免受邪恶人类和人猿好战派系的威胁……
故事讲述未来世界被恐怖的变异怪兽占领，幸存者被分割成小型部落，艰难地为生存而战。其中一个部落中的几个年轻人逃离了怪兽们的一次围攻，因而发现了外面有更多的人类生存，虽然他们过得其实也挺惨。
小高源吾是个喜爱怪兽的漫画家，但是自己所创作的怪兽往往不被自己的上司所欣赏，某天一个怪兽游乐园的人看中了他的作品于是雇用了小高，起初小高还很高兴的接下了这项工作，但是在过程当中却不断的发生奇怪的事情，也因此使得在怪兽岛的哥吉拉派遣安基拉斯来到日本，结果小高发现这居然是一场阴谋，而且这个阴谋正是以哥吉拉跟地球为目标.......
青木照（妻夫木聪 饰）在毕业旅行途中所搭乘的新干线遭遇了不明事故，抛锚在了漆黑的隧道之中。同样被困住的，还有青木的同级生濑户雅子（神田沙也加 饰）和高桥伸雄（山田孝之 饰）。三人在等待救援无果之后决定凭借自己的力量走出隧道，却在此过程中遭遇了一连串诡异又可怕的事件，最终，高桥疯了，意志力强大的青木和雅子抵达了隧道的终点。 本以为终于可以获救的两人震惊的发现，和隧道里的黑暗寂静相比，外部世界的疯狂和暴力才是真正的可怕所在。整个世界都沦陷了，天地之间一片荒芜的景象，活跃的是激进的自卫队和早已经变异扭曲的前人类。
午夜，一架从洛杉矶飞往波士顿的767客机突遭客舱失压泄气的危机。从沉睡中惊醒的布莱恩·恩格尔（大卫·摩斯 David Morse 饰）惊恐地发现，飞机上所有的乘客和机组人员都消失了，身边只剩下十个同样身处险境的男女老幼，手足无措。那些消失无踪的乘客所留下来的“遗物”，仍原封不动的停留在原处，好像不曾发生过任何事情，然而噩梦才刚刚开始。在三万七千英尺的高空之上，这些幸存的“生还者”将最后一丝希望付诸于地面，却完全联系不上，彻底失联。当他们将飞机着陆之后，一片死寂的地面更让他们惶恐不安。陆地上的城市似乎毫无变化，只是荒无人烟的景象，被深深的黑暗所笼罩，仿佛这些城市从来不曾存在过一样。在这片无人之境，空气是凝固的，声音是失真的，连食物也是索然无味的。每一个人都深陷在不祥的预感之中，不知所措，宛若砧板上的鱼肉任由宰割。正在这时，一个恐怖的声音正在向他们一步步地逼近，似乎要吞噬掉这群被时间遗忘的人。
探险家正风 (李修贤) 到森林探险，遇到大猩猩及女泰山阿维。惜正风误堕娱乐商人鲁天圈套，猩猩王被带往香港表演。阿维不忍心大猩猩被凌辱，伤心不已。鲁意图污辱阿维，猩猩王大怒，大肆捣乱…
在一个普通的夜晚，约翰（斯科特·阿金斯 Scott Adkins 饰）的家被几名蒙面人闯入，他遭到对方无情痛击，血流满面，疼痛难耐，接着妻子与可爱的女儿便在眼前被匪徒们枪杀。在昏迷长达数月后，约翰苏醒过来，他清楚记得曾摘下头套以真面目示人的匪徒头目的长相，从负责此案的FBI探员口中得知，此人名叫卢克·戴沃洛克斯（尚格·云顿 Jean-Claude Van Damme 饰），曾经是一名孔武骠悍的军人。约翰无论如何也想不透遭此厄运的缘由，回到家中，往昔美好情景历历浮现，令他痛苦不堪。在这一过程中，卢克宛如鬼魅一般时时刻刻搅扰约翰的神经，他尝试寻找真相，却发现那看似真实无疑的记忆竟也如此虚假。 与此同时，卢克和一群曾经被操控的战士组织了反政府的武装，时刻图谋推翻奴役他们的统治者……
